用前必读
1，使用输入检查工具（windows版）检查输入数据
2，使用excel存储并调整数据（wps不行），然后拷贝、粘贴到输入框
3，请勿使用特殊符号，例如#，<，>，%，（，），非英文字符等。默认仅支持英文字符（部分模块除外）
4，使用SVG编辑器或AI，inkscape修改文字、字体，图例，处理截断等，参考inkscape实操
5，生信分析项目合作请加管理员微信（页面右下）

人工客服  基因名转换  FC,P转换  常用配色  影响因子 新需求及bug提交  pdf转图片

必需输入（仅支持组比较，例如3vs3）
原始表达矩阵（行是基因，列是样品，表达值可以为0，不能为空或者NA
首列是基因名，必需唯一，可以用ID合并模块预处理后再提交
样品名、组名不带特殊符号，且样品名唯一）
数据较少，直接粘贴

数据较多（上传tab分割的txt文件，文件名用英文，不能超过10M）


比较方式（有几个比较就写几行，注意表头需要带上）
共5列：1）实验组样品，2）对照组样品，3）实验组组名，4）对照组组名，5）unpaired或者paired
1、2列样品间以英文逗号分隔，所有名字不要用特殊符号


可选输入
标准化
通过绘制box图，判断是否需要标准化，若box图很整齐则一般不用标准化



log2转化（fpkm，tpm等需要log2转化）
，加psudonumber，避免log2(0)：


默认输出全部结果，请下载后使用excel筛选差异基因

此分析将消耗 1 微币

表达谱limma差异分析

简介
本模块调用limma R包进行转录组差异表达分析，可用于affymetrix， agilent microarray芯片信号强度，RNA-seq的FPKM，TPM值等
输入数据
输入为表达矩阵，行是基因，基因名不能有重复，列是样品，样品名不能有特殊符号，不能重复。表达值可以为0，但是不能为空或者NA。默认使用 Benjamini & Hochberg（False discovery rate）算法对p值进行校正。
论文例子
Linear Models for Microarray Data
示例 示例数据
输出 1，表达谱，原始信号+ normalized 信号。
2，指定比较的差异总表，请使用excel自行过滤挑选差异表达基因 3，挑选后使用本站其他模块绘图：火山图、热图等

1）如何作图？
1，准备作图数据；2，用excel打开数据，调整为示例格式；3，将调整后的数据粘贴到输入框；4，选择参数；5，提交出图
2）为什么不出图？
对输入数据格式有严格要求。请观看输入框上面的视频介绍，并仔细阅读右侧说明，示例数据。
3）如何引用？
3000+篇google学术，2400+篇知网学术引用
推荐直接写网址
Cite: Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y. SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
Method: Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 20 Feb 2024), an online platform for data analysis and visualization.
Acknowledgement: We thank Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd. (https://www.bioinformatics.com.cn, last accessed on 20 Feb 2024) for providing data analysis and visualization support.
4）交流群/公众号