用前必读
1，使用输入检查工具检查输入数据，默认仅支持英文字符（部分模块除外）
2，使用excel存储并调整数据（wps不行），然后再粘贴到输入框
3，使用SVG图片编辑器修改文字、字体，图例位置，处理文字截断等，参考inkscape实操
4，生信分析项目合作
5，更多干货，页面右下扫描，关注”微生信“公众号或加群讨论！

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必需输入
输入miRNA（fasta格式）：



输入mRNA 3'UTR（fasta格式）


可选输入：
score（比对阈值，正值，越大越严格）
energy（能量阈值，负值，越小越严格）：

注意：1，miranda程序默认 score=140, energy=1，本站将energy默认改成了-1，要求更严格些
注意：2，结果中互补配对的图可以贴到word里边查看及美化
miranda在线预测miRNA靶基因推文

miRanda在线预测miRNA靶基因

简介
miRanda是一种检测基因组序列中miRNA潜在靶位点的算法。当前版本：v3.3a
miRanda is an algorithm for the detection of potential microRNA target sites in genomic sequences
两步策略：1，在查询的miRNA序列和mRNA 3'UTR序列间进行动态规划局部比对。这一比对过程基于序列互补（而不是序列一致性）打分；2，基于第一步获得的高分比对结果（sc参数控制），使用RNAlib（来自ViennaRNA包）评估比对的热力学稳定性。最终能量小于阈值（en参数控制）的结果作为最终结果。
源码见官网！
数据说明：
1，fasta格式的miRNA序列
2，fasta格式的mRNA 3'UTR序列，或者fasta格式的lncRNA序列，circRNA序列等目标序列
参考文献
A.J. Enright, B. John, U. Gaul, T. Tuschl, C. Sander, D.S. Marks; (2003) MicroRNA targets in Drosophila; Genome Biology 5(1):R1.
输入miRNA序列 
>hsa-miR-27b
UUCACAGUGGCUAAGUUCUGC
输入mRNA 3'UTR序列 
>Bcl3
GACGGATGGGGGGGCAGACCCGGACTCATGAGGAGGGGCCTCCCTGCCCTGT
GGGGACCACTCTTCTGGAAACTGTGAGGACCTTGTTCTGCTTCCCCCCGCCC
AATCCTCGGGACCAGGTTTTGCACCAAGGCACATGCACATACTACTGAGCACA
GATCCTCCCAATCGCGCCCCTTGCCCAGGACTCTCAGCCCCCACTTAATCTCA
GGCACCCAGGTTCCCTGTCTGGAATCCACCAGATACTCAATTCTTTGAGTGGA
GGAACCAAAGGACAGCCAGCCTCTCCTCTGCCACCCTCCACCCTGAGGGACCC
AGAGAAACAGAGGGGTCTGGGAGGGCATTGATCACAGTGTAAATTATTAGGTT
TGGGTCAGATTTCTTTTGTAATAAACTATTTTTGTATCAT
输出

1）如何作图？
1，准备作图数据；2，用excel打开数据，调整为示例格式；3，将调整后的数据粘贴到输入框；4，选择参数；5，提交出图

2）为什么不出图？
程序对输入格式有严格要求。请务必仔细查看右侧说明及示例数据

3）如何引用？
1300+篇google学术，~1000篇知网学术引用
请使用原生R包，Python包进行引用，或使用如下格式（推荐直接写网址）
Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 5 Jun 2023), an online platform for data analysis and visualization.

4）交流群/公众号