注意:作图前请务必查看右侧示例数据格式,输入数据格式必需与示例数据格式一致,制表符分割,否则做不了!
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冲积图(alluvial plot)


使用冲积图来绘制ceRNA网络,数据包括3列(mRNA-miRNA-LncRNA)。也可以推广到其他具有网络性质的数据上。
输入
id	mRNA	miRNA	LncRNA
1	mRNA4	miRNA1	lncRNA2
2	mRNA4	miRNA3	lncRNA3
3	mRNA3	miRNA5	lncRNA3
4	mRNA2	miRNA5	lncRNA2
5	mRNA8	miRNA4	lncRNA1
6	mRNA8	miRNA2	lncRNA3
输出

常见问题
  • 1,不出图?
  • 程序对输入格式有严格要求。请务必仔细查看右侧说明及示例数据。常见错误包括:非制表符分割,数据列数不对,没有带title等
  • 2,导出图片?
  • 低分辨率:QQ截图,日常使用
    矢量图:在生成的图上点击鼠标右键,在弹出的窗口中选择另存为(直接是svg格式文件,文件后缀不用改)。推荐使用chrome浏览器导出图片
  • 3,编辑图片,以满足杂志需求?
  • 默认Arial字体,下载Inkscape软件(最兼容,推荐,inkscape常用技巧),打开另存的svg文件,修改布局,文字等后,导出pdf或其他格式图片
  • 4,如何引用,how to cite?
  • 本站主要以matplotlib和各种R包绘图,由于本站内容未公开发表paper,如需引用,可使用如下格式:
    Heatmap was plotted by http://www.bioinformatics.com.cn, an online platform for data analysis and visualization.