用前必读
1,输入数据格式(标题、行、列)必需与示例一致,请仔细看右侧说明和示例,标能缺,不能有中文,特殊符号等
2,推荐使用excel存储并调整数据(wps不行),然后粘贴到输入框
3,修改文字、字体,图例位置,处理文字截断等图片编辑,请参考inkscape实操
4,更多干货,请右下扫码,关注”微生信“公众号或加群讨论!
注意:1,不要用微信打开,用浏览器,推荐edge或chrome!
2,分析、作图失败,请对照示例检查输入数据格式!
3,智能客服  人工客服  基因名转换  svg编辑器  FC,P转换  常用配色  影响因子  输入检查
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基因及log2倍数变化数据(带表头,全部基因,例如human的2w个):


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颜色(默认最多绘制10个基因集)
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基因集(默认10个基因以下,500个基因以上的基因集滤掉)











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自定义基因集,支持任意物种
(默认10个基因以下,500个基因以上的基因集滤掉)
(每行一个基因集,格式见示例):


待绘图基因集
每行一个基因集,名字来自输出结果的第一列
留空则默认最多绘制3条。仅支持最多绘制10条


P值表格


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在线GSEA分析,支持任意物种

此图将消耗 4 微币

基因集富集分析,gene set enrichment analysis (GSEA)分析

简介
使用clusterprofiler R包进行基因集富集分析,输入为所有基因及log2FC,按照log2FC从大到小排列。内置了来自GSEA官网的数据集,KEGG rat和mouse基因集。
数据说明
输入数据包括2列。第1列是基因symbol(例如人的是约20000个基因),第2列是log2FC,从大到小排列。
自定义基因集,例如铜死亡,铁死亡等(见示例)时,需要先选中自定义基因集按钮,然后粘贴感兴趣的基因集。制表符分割。
第一列是基因集名字(不要使用特殊符号),第二列是基因集来源(网址或者其他说明文字),第三列及以后为基因(必需在所有输入的基因中)。
论文例子
High expression of cuproptosis-related SLC31A1 gene in relation to unfavorable outcome and deregulated immune cell infiltration in breast cancer: an analysis based on public databases. fig6e
输入 示例数据
输出

1)如何作图?
1,准备作图数据;2,用excel打开数据,调整为示例格式;3,将调整后的数据粘贴到输入框;4,选择参数;5,提交出图

2)为什么不出图?
程序对输入格式有严格要求。请务必仔细查看右侧说明及示例数据

3)如何引用?
900+篇google学术,800+篇知网学术引用
请使用原生R包,Python包进行引用,或使用如下格式(推荐直接写网址)
Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 07 Jan 2023), an online platform for data analysis and visualization.

4)交流群/公众号