GO，Pathway富集结果气泡图

简介：
利用气泡图，将富集结果的p值以颜色表示，基因数用气泡大小表示。如何获得该数据，可以使用在线工具metascape提交基因，计算富集，得到结果后进行绘图
数据说明：
输入数据为4列，第一列是富集的名字（Y轴显示内容），第二列是富集倍数（X轴显示内容，若没有这个数据，可以用其他值代替，例如gene ratio等，都没有的话，1，用-log10(pvalue)代替这一列；2，用count代替这一列），第三列是p值（或者fdr也可以，即图中的颜色，根据p值变化），第四列是基因数（气泡大小）
输入数据为5列，第一列是富集的名字（Y轴显示内容），第二列是富集倍数（X轴显示内容，若没有这个数据，可以用其他值代替，例如gene ratio等，都没有的话，1，用-log10(pvalue)代替这一列；2，用count代替这一列），第三列是p值（或者fdr也可以，即图中的颜色，根据p值变化），第四列是基因数（气泡大小），第5列为可选列，为分类信息，例如BP，CC，MF等。若数据包含第5列，则根据第5列进行分面绘图：即同组的绘制在一起（字母顺序）
注意：1，输入可以是4列或5列。第5列可选，有则出分面图。
2，enrichment即-log10(p)，也可以用generatio等代替；
3，若无颜色，请将log(p)转成p，用excel的power命令=power(10,x)转化，或者p值转化，将log(p)转成p后，重新画图
4，若无点，请调大图片宽度
生物医学常见应用：
GO、Pathway富集分析结果气泡图展示。例子：Gene expression profiling and functional analysis reveals that p53 pathway-related gene expression is highly activated in cancer cells treated by cold atmospheric plasma-activated medium Fig 4

输入	示例数据
输出

1）如何作图？
1，准备作图数据；2，用excel打开数据，调整为示例格式；3，将调整后的数据粘贴到输入框；4，选择参数；5，提交出图

2）为什么不出图？
程序对输入格式有严格要求。请务必仔细查看右侧说明及示例数据

3）如何引用？
162篇文章引用我们（Google Scholoar）。请引用原生R包，Python包等，或使用如下格式：
Heatmap was plotted by http://www.bioinformatics.com.cn, a free online platform for data analysis and visualization.

4）其他常见问题