用前必读
1，使用excel存储并调整数据，然后拷贝、粘贴到输入框
2，先用输入框下方的“输入检查”按钮检查输入，通过后再作图
3，表头请勿使用#，<，>，%，(，)等特殊符号。默认仅支持英文字符
4，使用inkscape或者AI修改文字、字体，图例，处理截断
5，生信项目合作，提交bug、发文引用换积分，请加管理员微信（页面右下）

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必需输入  气泡图绘制视频教程  文字教程

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若颜色选择-log10转化，则标注为-log10(pvalue)。-log10及括号为后台自动添加
若颜色选择不转化，则标注为pvalue

p值是否-log10转换



颜色
-log10(pvalue)值小/pvalue值大的颜色：
-log10(pvalue)值大/pvalue值小的颜色：

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GO，Pathway富集结果气泡图

简介
利用气泡图，将富集结果的p值以颜色表示，基因数用气泡大小表示。如何获得该数据，可以使用在线工具metascape提交基因，计算富集，得到结果后进行绘图。调用ggplot2 R包
数据说明
1）输入数据为4列，第一列是富集的名字（Y轴显示内容），第二列是X轴显示内容，例如gene ratio等，第三列是p值（或者fdr，即图中的颜色，根据p值变化），第四列是基因数（气泡大小）
2）输入数据为5列，第一列是富集的名字（Y轴显示内容），第二列是X轴显示内容，例如gene ratio等，第三列是p值（或者fdr，即图中的颜色，根据p值变化），第四列是基因数（气泡大小），第5列为可选列，为分类信息，例如BP，CC，MF等。若数据包含第5列，则根据第5列进行分面绘图：即同组的绘制在一起
注意：1，输入可以是4列或5列。有第5列则出分面图。
2，generatio没有的话，可以用fold enrichment等有意义的值代替
3，p列不能为0或者负，若无颜色，使用p值转化，将log(p)转成p后，重新画图
4，若无点，请调大图片宽度
论文例子
Honghua extract mediated potent inhibition of COVID-19 host cell pathways
论文写作
Dot plot of the KEGG pathway enrichment analysis. The horizontal axis represents the gene ratio, while the vertical axis represents the enriched pathway name. The color scale indicates different thresholds of the p-value, and the size of the dot indicates the number of genes corresponding to each pathway.
输入 示例数据
输出

如何引用？

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正式引用：Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y.SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
方法章节：Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 10 Dec 2024), an online platform for data analysis and visualization.
致谢章节：We thank Mingjie Chen (Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd.) for providing data analysis and visualization support.