用前必读
1,使用输入检查工具检查输入数据
2,使用excel存储并调整数据(wps不行),然后拷贝、粘贴到输入框
3,请勿使用特殊符号,例如#,<,>,%,(,),非英文字符等。默认仅支持英文字符(部分模块除外)
4,使用SVG编辑器或者AI,inkscape修改文字、字体,图例位置,处理截断等,参考inkscape实操
5,生信分析项目合作请加管理员微信(页面右下)

人工客服  基因名转换  FC,P转换  常用配色  影响因子 新需求及bug提交  pdf转图片

必需输入(使用重复检查工具,检查基因名无重复,且没有inf,NA,空等后再用)
数据较少(直接拷贝数据并粘贴到输入框)

数据较多(上传tab分割的txt文件,文件名用英文)


可选输入
待标注基因(只贴名字,一行一个,留空则默认标注):

注意:出图后仔细看,若某基因没标上,则需要调整X和Y轴的范围
图片大小
图片宽:
图片高:

字体大小
点大小:
点标注大小(若标注的点有缺,缩小该字体大小):
legend字体大小:
legend图标大小:

颜色
不显著:
FC显著:
P显著:
FC和P都显著:

形状
不显著:
FC显著:
P显著:
FC和P都显著:

标注
不显著:
FC显著:
P显著:
FC和P都显著:

阈值,范围
P值阈值(默认0.05):
FC阈值(默认2.0。注意:这里是FC的阈值):
X轴最大值(最小值为负的最大值):
Y轴最大值(最小值为0):

其他
点透明度:
标题:

legend位置


标注是否带box(若有标注但无点,或者标注缺失,请选择不带box)


标注是否带线


字体


美美的火山图,带基因标注

增强的火山图(带标注)

简介
一般用于展示差异表达基因。调用enhancedvolcano R包绘图,图中不需要的文字等可以用inkscape去除
数据说明
输入包含3列,一般为未经过滤的全部数据。第一列为基因名(唯一,不能有重复);第二列为log2 fold change(上调为正,下调为负);第三列为P(或者FDR等统计量)。
论文例子
EnhancedVolcano: Publication-ready volcano plots with enhanced colouring and labeling
输入 示例数据
输出

1)如何作图?
1,准备作图数据;2,用excel打开数据,调整为示例格式;3,将调整后的数据粘贴到输入框;4,选择参数;5,提交出图
2)为什么不出图?
对输入数据格式有严格要求。请观看输入框上面的视频介绍,并仔细阅读右侧说明,示例数据。
3)如何引用?
2600+篇google学术,2100+篇知网学术引用
推荐直接写网址
Cite: Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y. SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
Method: Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 10 Nov 2023), an online platform for data analysis and visualization.
Acknowledgement: We thank Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd. (https://www.bioinformatics.com.cn, last accessed on 10 Nov 2023) for providing data analysis and visualization support.
4)交流群/公众号