用前必读
1,使用输入检查工具(windows版)检查输入数据。使用视频教程
2,使用excel存储并调整数据(wps不行),然后拷贝、粘贴到输入框
3,请勿使用特殊符号,例如#,<,>,%,(,),非英文字符等。默认仅支持英文字符(部分模块除外)
4,使用SVG编辑器或AI,inkscape修改文字、字体,图例,处理截断等,参考inkscape实操
5,生信分析项目合作请加管理员微信(页面右下)

人工客服  基因名转换  FC,P转换  常用配色 新需求及bug提交  pdf转图片
必需输入  美美的火山图,带基因标注
数据较少(直接拷贝数据并粘贴到输入框)

数据较多(上传tab分割的txt文件,文件名用英文)

可选输入
待标注基因(只贴名字,一行一个,留空则默认标注):

注意:出图后仔细看,若某基因没标上,则需要调整X和Y轴的范围
图片大小
图片宽度:;图片高度:

字体大小
点大小:
点标注大小(若标注的点有缺,缩小该字体大小):
legend字体大小:
legend图标大小:

颜色
不显著:
FC显著:
P显著:
FC和P都显著:

形状
不显著:
FC显著:
P显著:
FC和P都显著:

标注
不显著:
FC显著:
P显著:
FC和P都显著:

阈值,范围
P值阈值(默认0.05):
FC阈值(默认2.0。注意:这里是FC的阈值):
X轴范围(最小值和最大值必需同时有或者同时留空)
X轴最小值:;X轴最大值:
Y轴最大值(最小值为0):

其他
点透明度:
标题:

legend位置


标注是否带box(若有标注但无点,或者标注缺失,请选择不带box)


标注是否带线


字体


增强的火山图(带标注)

简介
一般用于展示差异表达基因。调用enhancedvolcano R包绘图,图中不需要的文字等可以用inkscape去除
数据说明
输入包含3列,一般为未经过滤的全部数据。第一列为基因名(唯一,不能有重复);第二列为log2 fold change(上调为正,下调为负);第三列为P(或者FDR等统计量)
论文例子
EnhancedVolcano: Publication-ready volcano plots with enhanced colouring and labeling
输入 示例数据
输出

1)如何作图?
1,数据放在excel里边,2,将自己的数据调整为示例样式;3,拷贝数据,粘贴到输入框;4,使用“输入检查”按钮检查输入,5,检查通过后选择参数,提交出图
2)如何引用?
建议直接写网址。3600+篇google学术,2800+篇知网学术
正式引用:Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y.SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
方法章节:Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 20 May 2024), an online platform for data analysis and visualization.
致谢章节:We thank Mingjie Chen (Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd.) for providing data analysis and visualization support.
3)交流群/公众号