用前必读
1,使用输入检查工具(windows版)检查输入数据
2,使用excel存储并调整数据(wps不行),然后拷贝、粘贴到输入框
3,请勿使用特殊符号,例如#,<,>,%,(,),非英文字符等。默认仅支持英文字符(部分模块除外)
4,使用SVG编辑器或AI,inkscape修改文字、字体,图例,处理截断等,参考inkscape实操
5,生信分析项目合作请加管理员微信(页面右下)

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必需输入
至少3列(chr, star, end,首行必需是每一列的描述) 数据较少,直接粘贴

数据较多(上传tab分割的txt文件,文件名用英文,不能超过10M)


promoter范围(TSS上游及下游)
upstream:
downstream:

基因组build(注意:这里用Ensembl gtf进行注释)





饼图字体


计算量较大,约30s出结果
此分析将消耗 3 微币

对染色体区域进行基因注释

简介
使用chipseeker R包对来自chip-seq, ATAC-seq,cut & tag等的富集峰(peak)区域进行基因注释,链接位置和基因信息(一般不考虑链方向)
输入数据
输入为bed格式:前3列为chrom,start,end,后边几列可选(注意:首行必需表明每一列数据是什么,即带表头。表头将用在最终的excel中,不要用特殊符号)
论文例子
示例 示例数据
输出
输出分成2部分:第一部分是输入的内容,第二部分是注释内容,包括:peak所在的基因组特征分类(例如3'UTR,5'UTR,promoter,intergenic等),基因名,描述等信息

1)如何作图?
1,准备作图数据;2,用excel打开数据,调整为示例格式;3,将调整后的数据粘贴到输入框;4,选择参数;5,提交出图
2)为什么不出图?
对输入数据格式有严格要求。请观看输入框上面的视频介绍,并仔细阅读右侧说明,示例数据。
3)如何引用?
3000+篇google学术,2400+篇知网学术引用
推荐直接写网址
Cite: Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y. SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
Method: Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 20 Feb 2024), an online platform for data analysis and visualization.
Acknowledgement: We thank Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd. (https://www.bioinformatics.com.cn, last accessed on 20 Feb 2024) for providing data analysis and visualization support.
4)交流群/公众号