用前必读
1,输入数据格式(标题、行、列)必需与示例一致,请仔细看右侧说明和示例,标能缺,不能有中文,特殊符号等
2,推荐使用excel存储并调整数据(wps不行),然后粘贴到输入框
3,修改文字、字体,图例位置,处理文字截断等图片编辑,请参考inkscape实操
4,更多干货,请右下扫码,关注”微生信“公众号或加群讨论!
注意:1,不要用微信打开,用浏览器,推荐edge或chrome!
2,分析、作图失败,请对照示例检查输入数据格式!
3,智能客服  人工客服  基因名转换  svg编辑器  FC,P转换  常用配色  影响因子  输入检查

必需输入
数据较少(直接拷贝数据并粘贴到输入框,带header):

数据较多(上传tab分割的txt文件,文件名用英文)


可选输入
图片大小
图片宽度:
图片高度:

文字说明
X轴说明:
Y轴说明:
up说明:
down说明:
无变化说明:

文字大小
轴刻度文字大小:
轴说明文字大小:
图例legend文字大小:
标注的基因名文字大小:

颜色
上调颜色:
下调颜色:
无变化颜色:
分隔线颜色:
点颜色透明度:

阈值及其他
P_min(例如小于1e-100的p值被设置为1e-100):
倍数变化阈值(必需>1):
P值或FDR等阈值:
marker点大小:
X轴最大值(最小值默认负的最大值):
Y轴最大值(最小值默认0):

点(marker)形状


网格


待标注基因(一行一个,必需在第一列中,大小写敏感)


字体


火山图(volcano plot)

简介
形如火山喷发,向两侧越来越宽,故名。
数据说明
数据包括3列,第1列是基因名,或者miRNA名,circRNA名字等,必需唯一;第2列是log2fc,上调>=0,下调<0,不能为空,inf,-inf;第3列为p值或fdr值,不能为空,NA等
注意:1,X轴是log2的,一般不超过15,若超过15,请检查输入数据!
论文例子
Identification of Gene Expression Changes Associated With Uterine Receptivity in Mice Fig 1A.
输入 示例数据
输出

1)如何作图?
1,准备作图数据;2,用excel打开数据,调整为示例格式;3,将调整后的数据粘贴到输入框;4,选择参数;5,提交出图

2)为什么不出图?
程序对输入格式有严格要求。请务必仔细查看右侧说明及示例数据

3)如何引用?
800+篇google学术,700+篇知网学术引用
请使用原生R包,Python包进行引用,或使用如下格式(推荐直接写网址)
Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 31 Oct 2022), an online platform for data analysis and visualization.

4)交流群/公众号