用前必读
1,使用输入检查工具(windows版)检查输入数据。使用视频教程
2,使用excel存储并调整数据(wps不行),然后拷贝、粘贴到输入框
3,请勿使用特殊符号,例如#,<,>,%,(,),非英文字符等。默认仅支持英文字符(部分模块除外)
4,使用SVG编辑器或AI,inkscape修改文字、字体,图例,处理截断等,参考inkscape实操
5,生信分析项目合作请加管理员微信(页面右下)

人工客服  基因名转换  FC,P转换  常用配色 新需求及bug提交  pdf转图片
必需输入  GO弦图视频教程   文字教程

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注意:字体太大时,文字会被截断,请使用AI编辑结果图片已显示所有元素

排序


线边框粗细(若为0,则无边框)

logFC颜色(若无logFC列则默认灰色,请用AI编辑以移除logFC颜色条)
低颜色:
中颜色:
高颜色:

term弦颜色(自定义10种,10+种用系统默认颜色)
颜色1:
颜色2:
颜色3:
颜色4:
颜色5:
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颜色10:

字体


GO chord图(GO弦图)

简介
使用弦图展示富集结果,左边是基因,右边是GO term,中间的连线表示从属关系。可以使用GO analysis或者metascape提交基因,计算富集,得到结果后进行绘图。参考格式转换页面。调用GOplot R包
输入数据说明
数据包括3部分,第一列是基因,最后一列是logFC(名字不变,仅替换数据即可),即基因的变化倍数,用于排序及基因块颜色(若没有logFC,程序会自动添加,基因色块用灰色)
其余列是GO term,其中1表示该基因在这个GO term中,0表示不在(必需是0或者1,不能是其他数值)。默认不过滤,即有几个显示几个,20-30个基因,6-8个term效果比较好。最多绘制30个。
注意:
1. 也可以用于具有类似包含关系的其他数据中,例如KEGG Pathway。
2. 若term名太长,可以用inkscape编辑svg输出图片。
3. 若不是正圆,修改图片长度或者高度参数。
4. 若logfc没显示,可以用编辑器编辑图片以显示。
论文例子
An intersectional analysis of LncRNAs and mRNAs reveals the potential therapeutic targets of Bi Zhong Xiao Decoction in collagen-induced arthritis rats
输入 示例数据
输出

1)如何作图?
1,数据放在excel里边,2,将自己的数据调整为示例样式;3,拷贝数据,粘贴到输入框;4,使用“输入检查”按钮检查输入,5,检查通过后选择参数,提交出图
2)如何引用?
建议直接写网址。3600+篇google学术,2800+篇知网学术
正式引用:Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y.SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
方法章节:Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 20 May 2024), an online platform for data analysis and visualization.
致谢章节:We thank Mingjie Chen (Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd.) for providing data analysis and visualization support.
3)交流群/公众号