用前必读
1,使用输入检查工具(windows版)检查输入数据。使用视频教程
2,使用excel存储并调整数据(wps不行),然后拷贝、粘贴到输入框
3,请勿使用特殊符号,例如#,<,>,%,(,),非英文字符等。默认仅支持英文字符(部分模块除外)
4,使用SVG编辑器或AI,inkscape修改文字、字体,图例,处理截断等,参考inkscape实操
5,生信分析项目合作请加管理员微信(页面右下)

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必需输入  circRNA吸附miRNA图视频教程   文字教程
输入circRNA数据(circRNA名字,1,circRNA长度):

输入miRNA结合数据(miRNA名字,开始,结束,长度约22nt)
多处时不重叠,例如可以是34-50,52-72。不能是34-52,50-70

可选输入
miRNA字体大小
circRNA字体大小
miRNA文字距离中心距离r:

颜色
circRNA颜色:
miRNA颜色:

字体


circRNA-miRNA结合圆形图

简介
circRNA可以通过吸附miRNA,调节miRNA靶基因的表达,即所谓的ceRNA机制。本图形象地展示了miRNA在circRNA上的结合位点。
数据说明
环状数据部分为3列:circRNA名字,起始坐标(默认1),终止坐标(即长度,这里改成自己的circRNA长度)。结合位置可以使用miRanda预测
miRNA数据部分3列:miRNA名字,结合起始坐标,结合终止坐标。默认按照坐标排序,且坐标无重叠,即miRNA坐标区段不连续
论文例子
Bioinformatics analysis of potential glioblastoma circular RNA sponge network
论文写作
Binding simulation between circRNA and miRNAs. circRNA was represented by outer green circle, and miRNAs were represented by inner red rectangle. The relative locations of miRNAs to circRNA represented the binding sites.
输入 示例数据
输出

1)如何作图?
1,数据放在excel里边,2,将自己的数据调整为示例样式;3,拷贝数据,粘贴到输入框;4,使用“输入检查”按钮检查输入,5,检查通过后选择参数,提交出图
2)如何引用?
建议直接写网址。3600+篇google学术,2800+篇知网学术
正式引用:Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y.SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
方法章节:Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 20 May 2024), an online platform for data analysis and visualization.
致谢章节:We thank Mingjie Chen (Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd.) for providing data analysis and visualization support.
3)交流群/公众号