注意:输入数据格式(行、列)必需与右侧示例一致,制表符分割
1,数据来自excel,直接拷贝待绘图数据,粘贴到输入数据框即可
2,数据来自txt,各列需要制表符(tab键)分割,直接拷贝数据,粘贴到输入数据框
3,修改文字字体,图例位置,处理文字截断等图片编辑,请参考inkscape实操
4,其他问题,请左侧扫码,关注”微生信智能客服“或加群讨论!
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绘图数据:


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请选择颜色数:

1)请选择scale方向(z-score转化)
row col none

2)请选择要显示的名字
基因名 样品名 基因名+样品名 都不显示

3)请选择聚类方向
基因聚类(横向) 样品聚类(纵向) 基因+样品聚类(双向) 不聚类(数据原始顺序)

4)请选择聚类方法
complete ward ward.D ward.D2 single average mcquitty median centroid
5)选择距离方法
correlation euclidean maximum manhattan canberra binary minkowski
6)是否显示网格线(默认不显示;显示的话,默认灰色)
yes no
此图将消耗 0 微币

聚类图,热图


简介:
利用颜色表示表达值(原始或标准化),并使用距离矩阵进行聚类。
数据说明:
第一行为group名字,第二行为样品名字,其余为数据(其中第一列是基因名)
注意:1,若基因有重名的,取均值;样品也不能有重名的。2,制表符分隔,可以在excel中做转化(例如log2等,这里默认数据已经处理好),然后贴过来。
变种:若数据仅0,1,那么可以选择前后两种颜色展示(例如黑白),若数据仅三种(例如-1,0,1),则可以选3种颜色展示。
生物医学常见应用:
基因表达聚类图。例子:Integrated network analysis to explore the key genes regulated by parathyroid hormone receptor 1 in osteosarcoma Fig 1.
输入 示例数据
输出

1)如何作图?
1,准备作图数据;2,用excel打开数据,调整为示例格式;3,将调整后的数据粘贴到输入框;4,选择参数;5,提交出图

2)为什么不出图?
程序对输入格式有严格要求。请务必仔细查看右侧说明及示例数据

3)如何引用?
162篇文章引用我们(Google Scholoar)。请引用原生R包,Python包等,或使用如下格式:
Heatmap was plotted by http://www.bioinformatics.com.cn, a free online platform for data analysis and visualization.

4)其他常见问题