注意:作图前请务必查看右侧示例数据格式,输入数据格式必需与示例数据格式一致,制表符分割,否则做不了!
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请选择文字大小及标注位置(默认上调标在X轴下面,下调标在X轴上面)
标注文字大小:
up标在X轴下面,down标在X轴上面
up标在bar上面,down标在bar下面

up标X轴下面,down标X轴上面时,文字距离轴的高度:
up标bar轴上面,down标bar轴下面时,文字距离bar高度占bar的比例:

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基因表达柱状图(bar plot)


采用柱形图绘制差异基因的上调和下调(包括miRNA,lncRNA,circRNA等等)倍数。X轴表示gene,Y轴表示变化倍数。红色表示上调,在X轴上方;绿色表示下调,在X轴下方
注意:数据需要先排序,分为两行:第一行表示不同基因;第二行表示倍数变化。方向不对的话,excel转置下。
输入
miRNAs	miR-1	miR-2	miR-3	miR-4	miR-5	miR-6
logFC	3.3	2.5	2.3	-2.2	-3.4	-3.8
输出

常见问题
  • 1,不出图?
  • 程序对输入格式有严格要求。请务必仔细查看右侧说明及示例数据。常见错误包括:非制表符分割,数据列数不对,没有带title等
  • 2,导出图片?
  • 低分辨率:QQ截图,日常使用
    矢量图:在生成的图上点击鼠标右键,在弹出的窗口中选择另存为(直接是svg格式文件,文件后缀不用改)。推荐使用chrome浏览器导出图片
  • 3,编辑图片,以满足杂志需求?
  • 默认Arial字体,下载Inkscape软件(最兼容,推荐,inkscape常用技巧),打开另存的svg文件,修改布局,文字等后,导出pdf或其他格式图片
  • 4,如何引用,how to cite?
  • 本站主要以matplotlib和各种R包绘图,由于本站内容未公开发表paper,如需引用,可使用如下格式:
    Heatmap was plotted by http://www.bioinformatics.com.cn, an online platform for data analysis and visualization.