用前必读
1,使用输入检查工具(windows版)检查输入数据
2,使用excel存储并调整数据(wps不行),然后拷贝、粘贴到输入框
3,请勿使用特殊符号,例如#,<,>,%,(,),非英文字符等。默认仅支持英文字符(部分模块除外)
4,使用SVG编辑器或AI,inkscape修改文字、字体,图例,处理截断等,参考inkscape实操
5,生信分析项目合作请加管理员微信(页面右下)

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必需输入  临床热图绘制视频
表达矩阵(带header):

分组信息(比表达矩阵多一列):


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矩阵颜色
低颜色:
中间颜色:
高颜色:

scale

row聚类方法



距离方法



分类形式分组颜色(例如性别,TNM分期),最多能画9组
设置了9个组,每组7种颜色,按首次出现的名字排序
组a:
组b:
组c:
组d:
组e:
组f:
组g:
组h:
组i:

数值形式分组颜色(例如riskscore,TMB),最多能画3组
设置了3个组,每组3种颜色(若第2、3种颜色一样,则自动转成2种颜色)
组1:
组2:
组3:

字体


带临床数据的热图 -- 给样品添加TNM分期

此图将消耗 6 微币

多分组临床热图

简介
在常规热图基础上添加多个样品分组的信息。一般样品较多,并且样品根据某分组信息排序,列不聚类,行聚类。
数据说明
输入数据包括2个:
1)表达矩阵:第一行是样品名,其余行是某基因在所有样品中的表达值。
2)与样品分组信息。其中第一列是分类的数据类型。若该行(分组)表示分类信息(例如性别,TNM分期),则写成category;若该行代表数值信息(例如riskscore),则写成number。样品顺序与表达矩阵一致。
样品分组信息比表达矩阵多一列表示category或者number的信息,具体请参考示例数据
论文例子
Integrated analysis of cervical squamous cell carcinoma cohorts from three continents reveals conserved subtypes of prognostic significance Fig 3.
输入 示例数据
输出

1)如何作图?
1,准备作图数据;2,用excel打开数据,调整为示例格式;3,将调整后的数据粘贴到输入框;4,选择参数;5,提交出图
2)为什么不出图?
对输入数据格式有严格要求。请观看输入框上面的视频介绍,并仔细阅读右侧说明,示例数据。
3)如何引用?
3000+篇google学术,2400+篇知网学术引用
推荐直接写网址
Cite: Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y. SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
Method: Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 20 Feb 2024), an online platform for data analysis and visualization.
Acknowledgement: We thank Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd. (https://www.bioinformatics.com.cn, last accessed on 20 Feb 2024) for providing data analysis and visualization support.
4)交流群/公众号