注意:作图前请务必查看右侧示例数据格式,输入数据格式必需与示例数据格式一致,制表符分割,否则做不了!
必需输入:
输入数据:


数据转换方法
不转换
-log10转化(针对p值,p=0时设置为10)
可选输入:
图边距(图长宽比例不协调,或者文字被截断情况下使用
右必需大于左;上必需大于下):
左:,右:
下:,上:
字体大小
GO term:,图例:
Y轴文字:,X轴文字:
是否在bar上标数值,及数值文字大小
不标
显示几位小数
0 1 2
标注数值文字大小:

颜色,每种term一种颜色,该颜色覆盖term说明,框线等
BP颜色:
CC颜色:
MF颜色:

GO term旋转角度:
由于框线角度会随着图大小变化,这里可以微调旋转角度,以保证文字与线平行

左侧位置:
修改这个值可以调整框线的角度,需要与上面的角度配合使用,以保证两者平行

三种分类文字与框线的距离:

此图将消耗 0 微币

富集GO term BP,CC,MF三合一柱状图


简介:
利用柱状图,将GO term的三个类别画在一起,并用框线分割表示。如何获得该数据,可以使用在线工具metascape提交基因,计算富集,得到结果后进行绘图
数据说明:
三列,第一列是GO term,第二列是分类(此列的文字及顺序必需为Biological process,Cellular component,Molecular function),第三列数值(可以是基因数,也可以是p值等)
生物医学常见应用:
GO富集分析结果图形展示。例子:Spatiotemporal Transcriptome Analysis Provides Insights into Bicolor Tepal Development in Lilium "Tiny Padhye" Fig 2A.

输入 示例数据
输出

常见问题
  • 1,不出图?
  • 程序对输入格式有严格要求。请务必仔细查看右侧说明及示例数据。常见错误包括:非制表符分割,数据列数不对,没有带title等
  • 2,导出图片?
  • 低分辨率:QQ截图,日常使用
    矢量图:在生成的图上点击鼠标右键,在弹出的窗口中选择另存为(直接是svg格式文件,文件后缀不用改)。推荐使用chrome浏览器导出图片
  • 3,编辑图片,以满足杂志需求?
  • 默认Arial字体,下载Inkscape软件(最兼容,推荐,inkscape常用技巧),打开另存的svg文件,修改布局,文字等后,导出pdf或其他格式图片
  • 4,如何引用,how to cite?
  • 本站主要以matplotlib和各种R包绘图,由于本站内容未公开发表paper,如需引用,可使用如下格式:
    Heatmap was plotted by http://www.bioinformatics.com.cn, an online platform for data analysis and visualization.