用前必读
1,使用输入检查工具(windows版)检查输入数据。使用视频教程
2,使用excel存储并调整数据(wps不行),然后拷贝、粘贴到输入框
3,请勿使用特殊符号,例如#,<,>,%,(,),非英文字符等。默认仅支持英文字符(部分模块除外)
4,使用SVG编辑器或AI,inkscape修改文字、字体,图例,处理截断等,参考inkscape实操
5,生信分析项目合作请加管理员微信(页面右下)

人工客服  基因名转换  FC,P转换  常用配色 新需求及bug提交  pdf转图片
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GO term:,图例:
Y轴文字:,X轴文字:
Y轴刻度最大值,最小值默认0:
Y轴刻度间隔:

是否在bar上标数值,及数值文字大小


显示几位小数

标注数值文字大小:

颜色,每种term一种颜色,该颜色覆盖term说明,框线等
BP颜色:
CC颜色:
MF颜色:

bar宽度:

GO term旋转角度:
由于框线角度会随着图大小变化,这里可以微调旋转角度,以保证文字与线平行

左侧位置:
修改这个值可以调整框线的角度,需要与上面的角度配合使用,以保证两者平行

字体


富集GO term BP,CC,MF三合一柱状图

简介
利用柱状图,将GO term的三个类别画在一起,并用框线分割表示。获得该数据的方式:使用GO/Pathway富集分析或者metascape提交基因,计算富集,得到结果后进行绘图
数据说明
三列,第一列是GO term,第二列是分类(此列的文字及顺序必需为Biological process,Cellular component,Molecular function),第三列是数值,可以是基因数,也可以是-log10(p)值等有意义的值,此列必需是正值,不能直接用p或者负的)
快速调整技巧:固定旋转角度,调整左侧位置。
论文例子
The anti-inflammatory mechanism of the medicinal fungus puffball analysis based on network pharmacology
论文写作
GO function analysis histogram. BP is marked by dark cyan, CC is marked by sienna and MF is marked by steel blue.
输入 示例数据
输出

1)如何作图?
1,数据放在excel里边,2,将自己的数据调整为示例样式;3,拷贝数据,粘贴到输入框;4,使用“输入检查”按钮检查输入,5,检查通过后选择参数,提交出图
2)如何引用?
建议直接写网址。3600+篇google学术,2800+篇知网学术
正式引用:Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y.SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
方法章节:Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 20 May 2024), an online platform for data analysis and visualization.
致谢章节:We thank Mingjie Chen (Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd.) for providing data analysis and visualization support.
3)交流群/公众号