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4,出图后用inkscape或acrobat illustrator修改pdf文字、字体,图例,处理截断
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基因集富集分析(GSEA)NES和FDR组合图

简介
用柱状图+点图的组合图展示基因集富集分析(GSEA)结果的的NES和FDR结果。其中左侧柱状图表示NES值,右侧点表示FDR值,与常规Y轴不同,这里右侧Y轴以log形式展示。
数据说明
数据为3列:第一列是基因集,第二列是NES值;第三列是FDR值(一般不要为0,可以写个极小值)。
论文例子
Hyperactivation of TORC1 drives resistance to the pan-HER tyrosine kinase inhibitor neratinib in HER2-mutant cancers. Fig2B
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正式引用:Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y. SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
方法章节:Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 10 Dec 2024), an online platform for data analysis and visualization.
致谢章节:We thank Mingjie Chen (Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd.) for providing data analysis and visualization support.