用前必读
1，使用excel存储并调整数据，然后拷贝、粘贴到输入框
2，先用输入框下方的“输入检查”按钮检查输入，通过后再作图
3，表头请勿使用#，<，>，%，(，)等特殊符号。默认仅支持英文字符
4，使用inkscape或者AI修改文字、字体，图例，处理截断
5，生信项目合作，提交bug、发文引用换积分，请加管理员微信（页面右下）

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必需输入（计算量较大，请勿大量提交）
数据1（例如lncRNA表达值，一般10个以下）：


数据2（例如mRNA表达值，一般100个以下）：

数据转化


相关系数


默认不对数据进行过滤，可以下载结果后自行过滤

lncRNA-mRNA共表达分析教程

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lncRNA-mRNA共表达分析

简介
一般认为具有相同表达模式的基因，可能共同发挥作用。lncRNA和mRNA的表达值，计算lncRNA和mRNA的表达pearson或者spearman相关系数。例如：相关系数>0.9，p<0.05（阈值请参考paper）则正相关，若相关系数<-0.9，p<0.05则负相关。
输入数据
输入为表达矩阵形式。第一行为样品名，剩余行为每个基因的表达值。例如芯片的标准化intensities；RNA-seq的FPKM、TPM、normalized counts等（最好加1，取log2进行数据转化后再计算）。
输出
pearson/spearman相关系数，可以根据相关系数值和p值过滤后，绘制共表达网络图。
示例 示例数据
输出 相关系数及p值

如何引用？

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正式引用：Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y.SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
方法章节：Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 10 Dec 2024), an online platform for data analysis and visualization.
致谢章节：We thank Mingjie Chen (Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd.) for providing data analysis and visualization support.