用前必读
1,使用输入检查工具(windows版)检查输入数据
2,使用excel存储并调整数据(wps不行),然后拷贝、粘贴到输入框
3,请勿使用特殊符号,例如#,<,>,%,(,),非英文字符等。默认仅支持英文字符(部分模块除外)
4,使用SVG编辑器或AI,inkscape修改文字、字体,图例,处理截断等,参考inkscape实操
5,生信分析项目合作请加管理员微信(页面右下)

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必需输入
原始表达矩阵(行是基因,列是样品)
数据较少,直接粘贴

数据较多(上传tab分割的txt文件,文件名用英文,不能超过10M)


数据来源平台



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根据表达谱进行肿瘤纯度计算

简介
原理:利用预先收集好的免疫基因集和基质基因集,通过ssGSEA算法计算每个样本各自基因集的得分。本模块以表达谱为输入,调用estimate R包进行基质细胞打分(StromalScore),免疫细胞打分(ImmuneScore),综合打分(ESTIMATEScore,基质细胞打分和免疫细胞打分的和),肿瘤纯度(TumorPurity)计算
输入数据
输入为表达谱矩阵。行为基因,列为样品,不能有空的单元格。
论文例子
示例 示例数据
输出 输出包括5列:1,样品名;2,stromscore;3,immuscore,4,estimatescore,5,tumor purity。
可以使用这些得分将样品重新分组,计算差异表达等一系列下游分析。

1)如何作图?
1,数据放在excel里边,2,根据示例的行或者列,调整为示例样式;3,将调整后的数据拷贝粘贴到输入框;4,选择参数;5,提交出图
2)为什么不出图?
1,输入检查工具初步检查输入,根据提示修正;2,观看输入框上面的B站视频介绍;3,并仔细阅读右侧说明,示例数据;4,提交人工客服处理
3)如何引用?
建议直接写网址。3400+篇google学术,2700+篇知网学术
正式引用:Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y.SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
方法章节:Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 20 May 2024), an online platform for data analysis and visualization.
致谢章节:We thank Mingjie Chen (Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd.) for providing data analysis and visualization support.
4)交流群/公众号