根据表达谱进行肿瘤纯度计算

简介
原理：利用预先收集好的免疫基因集和基质基因集，通过ssGSEA算法计算每个样本各自基因集的得分。本模块以表达谱为输入，调用estimate R包进行基质细胞打分（StromalScore），免疫细胞打分（ImmuneScore），综合打分（ESTIMATEScore，基质细胞打分和免疫细胞打分的和），肿瘤纯度（TumorPurity）计算
输入数据
输入为表达谱矩阵。行为基因，列为样品，不能有空的单元格。
论文例子

示例	示例数据
输出	输出包括5列：1，样品名；2，stromscore；3，immuscore，4，estimatescore，5，tumor purity。 可以使用这些得分将样品重新分组，计算差异表达等一系列下游分析。

如何引用？

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正式引用：Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y.SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
方法章节：Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 10 Dec 2024), an online platform for data analysis and visualization.
致谢章节：We thank Mingjie Chen (Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd.) for providing data analysis and visualization support.