用前必读
1,使用输入检查工具(windows版)检查输入数据
2,使用excel存储并调整数据(wps不行),然后拷贝、粘贴到输入框
3,请勿使用特殊符号,例如#,<,>,%,(,),非英文字符等。默认仅支持英文字符(部分模块除外)
4,使用SVG编辑器或AI,inkscape修改文字、字体,图例,处理截断等,参考inkscape实操
5,生信分析项目合作请加管理员微信(页面右下)

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必需输入(GOID,一行一个)  GOID批量转名字,并分配BP,CC,MF分类视频

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GOID批量转名字,并分配BP,CC,MF分类

简介
基因本体论(Gene Ontology,GO)(http://www.geneontology.org)为注释基因、基因产物和序列开发了一套结构化的、受控词汇表。GO被分成三部分:生物学过程(Biological Process,BP)、细胞组分(Cell Component,CC)和分子功能(Molecular Function,MF)。 本模块剖析GO官网下载的go-basic.obo文件(20240219更新),为每个GOID分配对应的GO term及分类。可以为KOBAS等没有GO分类信息的富集结果添加分类信息,然后进行GO分类绘图。
输入输出
输入为GOID,例如GO:0045177。一行一个,支持批量分配。
输出为:转化后的结果。未转化的结果(例如错误ID,过期的ID等)。
示例
GO:0045177
GO:0005774
输出
GOID	GO term	Class
GO:0045177	apical part of cell	molecular_function
GO:0005774	vacuolar membrane	molecular_function

1)如何作图?
1,数据放在excel里边,2,根据示例的行或者列,调整为示例样式;3,将调整后的数据拷贝粘贴到输入框;4,选择参数;5,提交出图
2)为什么不出图?
1,输入检查工具初步检查输入,根据提示修正;2,观看输入框上面的B站视频介绍;3,并仔细阅读右侧说明,示例数据;4,提交人工客服处理
3)如何引用?
建议直接写网址。3400+篇google学术,2700+篇知网学术
正式引用:Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y.SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
方法章节:Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 20 May 2024), an online platform for data analysis and visualization.
致谢章节:We thank Mingjie Chen (Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd.) for providing data analysis and visualization support.
4)交流群/公众号