基因排序图
简介
根据基因的log2FC将基因从高到低排序,然后绘图。X轴是排序rank,Y轴是log2FC,点表示基因,点的大小表示log2FC的绝对值,颜色表示p值。
数据说明
输入数据为3列:第1列是基因(必须唯一,不能有特殊符号);第2列是log2FC(或者其他有正有负的值,例如GSEA的NES);第3列是p值或者fdr等。
论文例子
Potent prophylactic cancer vaccines harnessing surface antigens shared by tumour cells and induced pluripotent stem cells. Fig 1B
如何引用?
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(知网)论文
正式引用:Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y.
SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
方法章节:Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on May 4, 2026), an online platform for data analysis and visualization.
致谢章节:We thank Mingjie Chen (Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd.) for providing data analysis and visualization support.