用前必读
1，使用excel存储并调整数据，数据不要有空的单元格
2，先用输入框下方的“输入检查”按钮检查输入，通过后再作图
3，表头请勿使用#，<，>，%，(，)等特殊符号。默认仅支持英文字符
4，出图后用inkscape或acrobat illustrator修改pdf文字、字体，图例，处理截断
5，生信项目合作，提交bug、发文引用换积分，请加管理员微信（右下）

人工客服   基因名转换   FC,P转换   智能配色   需求及bug提交   pdf转图片
必需输入  GSEA视频教程   文字教程
注1：用全部基因（例如人的2w个基因），不要过滤
注2：按照log2FC从大到小排序
可选输入
图片大小
图片宽度：
图片高度：
字体大小：

待分析基因集中基因个数阈值
最小基因数（若基因集中基因数小于该数值，则不参与分析）：
最大基因数（若基因集中基因数大于该数值，则不参与分析）：

颜色（超过10种使用系统默认颜色）
颜色集
自定义

颜色01-02： ；
颜色03-04： ；
颜色05-06： ；
颜色07-08： ；
颜色09-10： ；

数据库，基因集名，基因集中包含的基因集个数
基因集个数越多，运行越慢，20260411更新




























下载
















下载
下载
下载
下载
下载
下载
下载

自定义基因集（此框内有数据则默认自定义）
（例如铜死亡，铁死亡，细胞焦亡等），支持任意物种


待绘图基因集名字（根据第一遍运行结果填此框）
留空则默认最多绘制3条


P值表格（图中显示的数值精度不够，建议对照结果表格后期P下）


字体


此图将消耗 4 微币

基因集富集分析（gene set enrichment analysis，GSEA）

简介
使用clusterprofiler R包进行基因集富集分析，输入为所有基因及log2FC，按照log2FC从大到小排列。内置了来自GSEA官网的基因集，以及自制的KEGG基因集。
数据说明
输入数据包括2列。第1列是基因symbol（例如人的是约20000个基因），大小写敏感；第2列是log2FC，从大到小排列（不排列的话，结果略有差异）。
自定义基因集框中有数据则自动切换自定义模式。例如铜死亡，铁死亡等（见示例），制表符分割。
第一列是基因集名字（不要使用特殊符号），第二列是基因集来源（网址或者其他说明文字），第三列及以后为基因（必需在所有输入的基因中）。
论文例子
High expression of cuproptosis-related SLC31A1 gene in relation to unfavorable outcome and deregulated immune cell infiltration in breast cancer: an analysis based on public databases. fig6e
常见问题
1，为什么有些pathway的p值是NA？
某些通路中存在不平衡的（positive和negative）基因水平统计值，P-values被设置为NA。
输入 示例数据
输出

如何引用？

建议直接写网址。助力发表9800+篇（google学术），8500+篇（知网）论文
正式引用：Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y. SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
方法章节：Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on May 4, 2026), an online platform for data analysis and visualization.
致谢章节：We thank Mingjie Chen (Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd.) for providing data analysis and visualization support.