多分组临床热图
简介
在常规热图基础上添加多个样品分组的信息。一般样品较多,并且样品根据某分组信息排序,列不聚类,行聚类。
数据说明
输入数据包括2个:
1)表达矩阵:第一行是样品名,其余行是某基因在所有样品中的表达值。
2)与样品分组信息。其中第一列是分类的数据类型。若该行(分组)表示分类信息(例如性别,TNM分期),则写成category;若该行代表数值信息(例如riskscore),则写成number。样品顺序与表达矩阵一致。
样品分组信息比表达矩阵多一列表示category或者number的信息,具体请参考示例数据
论文例子
Integrated analysis of cervical squamous cell carcinoma cohorts from three continents reveals conserved subtypes of prognostic significance Fig 3.
如何引用?
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(知网)论文
正式引用:Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y.
SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
方法章节:Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on May 4, 2026), an online platform for data analysis and visualization.
致谢章节:We thank Mingjie Chen (Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd.) for providing data analysis and visualization support.