多层从属关系圈图(网络图)
简介
根据元素的层次关系,绘制圆圈网络图。中心为根节点,内圈为根节点延伸出来的节点,外圈为内圈所属的节点。该图可以用来展示多层从属关系类型数据的结果(例如OTU从属关系,基因在GO或者Pathway的从属关系等),美观大方。调用ggraph R包绘制。
数据说明
数据包括N列:第1列到倒数第3列是内圈的分类信息;倒数第2列是最外圈的点,倒数第1列是最外圈的点对应的数值。在示例文件中第1列是phylum(门),第2列是class(纲);第3列是对应的值,外圈的点大小按照这一列进行映射,必需为正值)。
论文例子
A Prospective Study of Circulating Tumor DNA to Guide Matched Targeted Therapy in Lung Cancers. Fig 1
如何引用?
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(知网)论文
正式引用:Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y.
SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
方法章节:Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 10 Dec 2024), an online platform for data analysis and visualization.
致谢章节:We thank Mingjie Chen (Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd.) for providing data analysis and visualization support.