TCGA泛癌基因表达与微卫星不稳定性（MSI）相关性雷达图

简介
微卫星不稳定性（Microsatellite Instability, MSI）是一种由DNA错配修复系统（Mismatch Repair, MMR）功能缺陷引起的现象，这种缺陷导致DNA复制过程中产生的错配不能被有效修复，从而在微卫星区域（短串联重复序列）产生插入或缺失的突变。 MSI的检测对于肿瘤的早期诊断、预后判断、化疗敏感性判断以及高危人群的圈定等具有重要意义。例如，在结直肠癌中，MSI-H（微卫星高度不稳定）的患者通常具有较好的预后。此外，MSI状态也与免疫治疗反应相关，MSI-H的肿瘤由于具有更多的新生抗原，可能对PD-1/PD-L1抑制剂等免疫治疗药物有更好的反应。 此图展示了某基因在TCGA数据库的33种癌症（泛癌）中的TPM表达值与样品微卫星不稳定性值间的相关性雷达图。
数据说明
输入蛋白编码基因名（symbol）即可查询，例如KLF7。输出为极坐标雷达图，表示相关系数
论文例子
引用请使用：Liao C, Wang X. TCGAplot: an R package for integrative pan-cancer analysis and visualization of TCGA multi-omics data. BMC Bioinformatics. 2023 Dec 17;24(1):483. doi: 10.1186/s12859-023-05615-3. PMID: 38105215; PMCID: PMC10726608.
注：经与作者沟通，在线版免费开放使用，数据和代码均来自TCGAplot包，本站仅对样式略有调整。数据相关问题可联系本站管理员或者到王老师Github留言讨论。

输入	KLF7
输出

如何引用？

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正式引用：Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y.SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
方法章节：Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 10 Dec 2024), an online platform for data analysis and visualization.
致谢章节：We thank Mingjie Chen (Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd.) for providing data analysis and visualization support.